根据上述职责，市科学技术局设10个内设机构。
（一）办公室
协助局领导处理日常政务工作；负责文电、文秘、会务、机要、档案等机关日常工作；承担信息、安全、保密、政务公开、机关财务、内部审计和国有资产管理等工作；负责编制本部门预算，并监督预算执行；负责机关和指导局属单位的人事管理、机构编制、劳动工资、干部培训、计划生育、离退休人员服务；负责工、青、妇，党务和信访工作。
联系电话：83385761，传真：83355500
（二）政策法规科
牵头拟订全市科学技术工作配套政策和实施细则，并指导、监督、贯彻实施。组织企业研究开发费税前扣除技术鉴定；协调指导全市科普工作；组织软科学研究工作；负责民营科技企业工作；会同有关部门推荐创新型企业、自主创新产品和创新科研团队；会同有关部门编制全市创新体系建设规划；牵头承担人大议案、政协提案的办理；落实科技兴市相关工作，承担党政领导班子推动科技进步实绩考核工作。
联系电话：83355950
（三）发展规划科
组织研究科技发展战略，拟订科技发展中长期规划；指导和推动战略性新兴产业发展；负责佛山市科技发展专项资金管理；负责组织佛山市工业、农业及社会发展领域科技攻关及项目的申报和监督管理；负责国家农业科技成果转化资金项目申报指导；负责组织科技重大专项申报和监督管理工作；负责专业镇管理工作；承担科技统计管理工作；承担市科技装备动员办公室日常工作。
联系电话：83355841
（四）综合计划科
提出科技、知识产权基础条件平台及有关重点创新基地建设规划建议，指导市内科技、知识产权平台和国家、省级、市级工程中心建设；会同有关部门提出科技、知识产权资源合理配置的政策和措施建议；编制经费预算，并监督预算执行；协调各级科技、知识产权项目的跟进管理；参与拟订重大科技、知识产权投入政策和经费管理办法，承担财政科技、知识产权投入绩效评价和科技、知识产权金融结合工作；负责宣传工作。
联系电话：83036135
（五）高新技术科
拟订相关领域高新技术发展及产业化的政策措施和规划方案；组织开展制造业信息化工作；组织高新技术企业和高新技术产品的认定申报；组织实施高新技术领域科技攻关及高新技术项目；负责组织国家和省重点新产品项目、火炬计划的申报和实施管理工作；负责粤港关键领域重点突破项目组织实施和监督管理；负责国家、省、市科技型中小企业创新基金项目组织实施和监督管理；指导、协调高新技术产业开发区等园区、产业基地建设。
联系电话：83355498
（六）产学研结合科
牵头拟订产学研结合的政策措施，编制产学研结合发展规划、年度计划；负责产学研及中科院与佛山市合作项目的组织实施和相关专项资金使用的监督管理；组织实施企业科技特派员行动计划、产学研创新联盟、产学研结合示范基地和产学研结合创新平台建设；指导中科院佛山产业技术创新与育成中心、科研院校驻佛山办事机构业务工作的开展；承担中科院佛山市政府院市合作领导小组日常工作。
联系电话：83036137
（七）科技交流合作科
拟订科技交流与合作的政策措施；开展科技招商工作，负责组织国内外高新技术项目、国内外创新团队和领军人才的引进工作，组织国内外科研机构、国内外大中型企业的研究开发机构、检测及中介服务机构、产学研、院市合作等创新平台的引进工作；组织实施政府间及有关国际组织间的科技交流与合作，指导民间国际科技合作交流；承担有关国际学术会议的组织工作，组织国(境)外科技展览会及科技合作与交流工作；负责区域科技合作的协调，承办涉港澳台地区科技合作与交流事宜；承担科技外事工作的审核申报。
联系电话：83366392
（八）科技服务与管理科
拟订科技服务业发展专项规划和相关政策；拟订科技成果评价、登记、奖励、技术保密的管理办法并组织实施；组织实施国家和省科技成果重点推广计划；指导和监督管理技术市场、科技中介组织；承担科技评估、科技咨询、技术转移等科技服务行业监督管理工作；承担技术合同认定登记以及科技成果展览、技术交易会的组织工作；会同有关部门推进农村信息直通车工程建设；指导我市生产力促进机构工作。
联系电话：83350885
（九）知识产权规划管理科
承担统筹、协调、指导和拟定知识产权战略实施的有关工作，指导知识产权交易平台的建设工作；负责专利实施计划项目管理和监督；承担专利奖励、资助政策及措施的组织落实工作；牵头开展知识产权的对外联络、合作与交流活动；牵头建立重大经济活动知识产权特别审查制度并推动相关工作的开展；承担组织建立知识产权预警机制和专利联盟的相关工作。推动知识产权信息网络平台建设、指导区知识产权信息化建设；指导依法行政和普法工作；指导专利中介和代理机构开展工作；推动知识产权统计、考核制度的相关工作。
联系电话：83997298
（十）知识产权法制科
负责制定全市知识产权保护工作政策和措施并组织落实；牵头建立知识产权执法协作机制；负责专利行政执法工作，依法调解和处理专利纠纷，查处假冒专利行为；指导行业协会开展知识产权工作；负责专利行政诉讼、行政复议工作；指导维权援助中心开展维权援助工作；组织协助我市企事业单位应对国际知识产权纠纷，参与知识产权的涉外谈判。
联系电话：83997299
